Ответ: право на материнский капитал возникает не у ребенка, а у родителя (матери или отца) (ч.1 ст.3 №256-ФЗ). И с точки зрения получения капитала не принципиально, кто из двойняшек будет выступать в роли второго ребенка. То есть, подавая документы на «материнский» сертификат, вы можете приложить свидетельство о рождении любого из близнецов. Сумма капитала при этом не удваивается.
Но в вашем случае возникает право на региональный материнский капитал.